Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med13Q5SWW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms