Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810065E05RikQ5NC41 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1810065E05RikQ5NC41 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms