Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp22Q5DU02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp22Q5DU02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms