Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU00

Dcdc2, Doublecortin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2Q5DU00 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dcdc2Q5DU00 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dcdc2Q5DU00 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms