Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa20Q45VN2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa20Q45VN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms