Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1B8

Gal3st4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st4Q3V1B8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gal3st4Q3V1B8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gal3st4Q3V1B8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms