Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc43Q3V0L5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc43Q3V0L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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