Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrc1Q3UPH1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms