Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ceacam12Q3UKP4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam12Q3UKP4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms