Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms