Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms