Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip13Q3UA06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms