Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Hvcn1Q3U2S8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Hvcn1Q3U2S8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hvcn1Q3U2S8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms