Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem35bQ3U0Y2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms