Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim6Q3U0I6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim6Q3U0I6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms