Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
InipQ3TXT3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms