Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc136Q3TVA9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms