Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms