Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml4Q3LRV9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml4Q3LRV9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms