Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NeblQ0II04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NeblQ0II04 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NeblQ0II04 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms