Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms