Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnal1Q05A62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnal1Q05A62 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnal1Q05A62 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms