Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcn1Q05186 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcn1Q05186 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms