Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox13Q04891 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sox13Q04891 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms