Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Muc1Q02496 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms