Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Grin2bQ01097 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Grin2bQ01097 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms