Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms