Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms