Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg1P97376 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg1P97376 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms