Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3eP70275 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms