Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra1P62812 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms