Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc6P62334 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc6P62334 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms