Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms