Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ufm1P61961 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms