Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl8P59280 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl8P59280 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms