Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphp4P59240 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nphp4P59240 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nphp4P59240 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms