Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms