Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp20P57748 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp20P57748 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms