Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp25P57080 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms