Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmchP56942 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmchP56942 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmchP56942 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PmchP56942 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PmchP56942 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmchP56942 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmchP56942 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PmchP56942 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmchP56942 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms