Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp1P56183 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp1P56183 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms