Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aqp4P55088 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms