Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PltpP55065 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PltpP55065 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PltpP55065 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PltpP55065 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PltpP55065 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PltpP55065 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PltpP55065 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PltpP55065 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PltpP55065 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PltpP55065 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PltpP55065 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PltpP55065 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PltpP55065 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PltpP55065 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PltpP55065 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms