Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNB3P54284 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms