Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUP98P52948 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP98P52948 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP98P52948 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP98P52948 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP98P52948 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP98P52948 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP98P52948 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP98P52948 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP98P52948 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP98P52948 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP98P52948 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms