Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LtbrP50284 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LtbrP50284 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LtbrP50284 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms