Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax9P47242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms