Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2aP35436 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Grin2aP35436 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Grin2aP35436 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Grin2aP35436 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms