Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc1P34928 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc1P34928 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms