Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnd3P30282 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd3P30282 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms