Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Epha3P29319 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha3P29319 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha3P29319 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epha3P29319 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha3P29319 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha3P29319 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms